Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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