Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMC2Q13753 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms