Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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TUBB3Q13509 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBB3Q13509 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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