Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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