Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRAF3Q13114 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAF3Q13114 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAF3Q13114 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRAF3Q13114 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRAF3Q13114 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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