Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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