Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MKRN3Q13064 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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