Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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