Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXD4Q12950 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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