Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RAB40BQ12829 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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RAB40BQ12829 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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RAB40BQ12829 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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RAB40BQ12829 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RAB40BQ12829 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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RAB40BQ12829 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB40BQ12829 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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