Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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