Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YDR262WYDR262W 819 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 VMA7YGR020C 357 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 EST3YIL009C-A 546 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YJL202CYJL202C 348 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YPR014CYPR014C 330 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 UTP5YDR398W 1932 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 ESC2YDR363W 1371 nt2.59□□□□□ -2
NFI1Q12216 BFR1YOR198C 1413 nt2.59□□□□□ -2
NFI1Q12216 YPL216WYPL216W 3309 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 GPI19YDR437W 423 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 RPL23BYER117W 414 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 MIC19YFR011C 513 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 THG1YGR024C 714 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 ERG25YGR060W 930 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 BTN2YGR142W 1233 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 PCL5YHR071W 690 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 PAI3YMR174C 207 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 PEX27YOR193W 1131 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 ALY1YKR021W 2748 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 SAG1YJR004C 1953 nt2.58□□□□□ -2
NFI1Q12216 AXL1YPR122W 3627 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YJL132WYJL132W 2253 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 SPF1YEL031W 3648 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 NAB3YPL190C 2409 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YDR090CYDR090C 933 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 HMF1YER057C 390 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 GEP7YGL057C 864 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YIP5YGL161C 933 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YGR050CYGR050C 357 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 RPL14BYHL001W 417 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 RNR2YJL026W 1200 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 SMD2YLR275W 333 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 ECI1YLR284C 843 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 RGM1YMR182C 636 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YOR097CYOR097C 528 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 YCT1YLL055W 1596 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 DYN1YKR054C 12279 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 HRD3YLR207W 2502 nt2.57□□□□□ -2
NFI1Q12216 MRD1YPR112C 2664 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 NEW1YPL226W 3591 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 TOF1YNL273W 3717 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 ADK1YDR226W 669 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 YFR057WYFR057W 456 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 YGL230CYGL230C 444 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 RTS3YGR161C 792 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 YPT52YKR014C 705 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 JIP3YLR331C 378 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 RPL19BYBL027W 570 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 RPL25YOL127W 429 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 CIN2YPL241C 807 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 ROY1YMR258C 1662 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 YNL018CYNL018C 1839 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 NPR1YNL183C 2373 nt2.56□□□□□ -2
NFI1Q12216 SNA4YDL123W 423 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 ERP6YGL002W 651 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 MES1YGR264C 2256 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 HOS4YIL112W 3252 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 VPH2YKL119C 648 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 LST4YKL176C 2487 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 MGE1YOR232W 687 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 YIL080WYIL080W 4722 nt2.55□□□□□ -2
NFI1Q12216 PCK1YKR097W 1650 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 YDL157CYDL157C 357 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 YEA4YEL004W 1029 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 RPL36AYMR194W 303 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 YBR062CYBR062C 543 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 RXT2YBR095C 1293 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 DAD3YBR233W-A 285 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 INP51YIL002C 2841 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 SNX41YDR425W 1878 nt2.54□□□□□ -2
NFI1Q12216 YIL166CYIL166C 1629 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 EDS1YBR033W 2760 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 MFB1YDR219C 1398 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 INP53YOR109W 3324 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 NSE4YDL105W 1209 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 RMD6YEL072W 696 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 IKI1YHR187W 930 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 CBP6YBR120C 489 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 CYR1YJL005W 6081 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 SCY1YGL083W 2415 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 PSK2YOL045W 3306 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 GPI17YDR434W 1605 nt2.53□□□□□ -2
NFI1Q12216 UBP16YPL072W 1500 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YFH1YDL120W 525 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 RPL27BYDR471W 411 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 STE2YFL026W 1296 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YML037CYML037C 1023 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 TUS1YLR425W 3924 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YDR186CYDR186C 2634 nt2.52□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 NUP100YKL068W 2880 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 RGL1YPL066W 1440 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 HSC82YMR186W 2118 nt2.51□□□□□ -2.01
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