Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 SDL1YIL167W 633 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YJL086CYJL086C 369 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 ATP18YML081C-A 180 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YOR296WYOR296W 3870 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YRR1YOR162C 2433 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 TAO3YIL129C 7131 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 APC11YDL008W 498 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 EMC4YGL231C 573 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 RPL19BYBL027W 570 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 INP1YMR204C 1263 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 DSE4YNR067C 3354 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 CSR2YPR030W 3366 nt2.96□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 PSK1YAL017W 4071 nt2.95□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 ACF4YJR083C 930 nt2.95□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YLR224WYLR224W 1110 nt2.95□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 MSN1YOL116W 1149 nt2.95□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YPR014CYPR014C 330 nt2.95□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 CDC55YGL190C 1581 nt2.95□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YDL180WYDL180W 1644 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 snR59snR59 78 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YDR029WYDR029W 315 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SLX9YGR081C 633 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YGR228WYGR228W 345 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YIL054WYIL054W 318 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 Q0017Q0017 162 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 RCY1YJL204C 2523 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 RPA190YOR341W 4995 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 MES1YGR264C 2256 nt2.94□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 GAL80YML051W 1308 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SNQ2YDR011W 4506 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 DOA4YDR069C 2781 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 PAM1YDR251W 2493 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 BUD19YJL188C 309 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YAL037WYAL037W 804 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 ILV5YLR355C 1188 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 snR191snR191 274 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 PRP8YHR165C 7242 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 CTF13YMR094W 1437 nt2.93□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SHE4YOR035C 2370 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 RMT2YDR465C 1239 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 ERG28YER044C 447 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 LRP1YHR081W 555 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YAP5YIR018W 738 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 LOA1YPR139C 903 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SEN54YPL083C 1404 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YOL057WYOL057W 2136 nt2.92□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SPO14YKR031C 5052 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 AFR1YDR085C 1863 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YGR242WYGR242W 309 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 MRP49YKL167C 414 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 RPL8BYLL045C 771 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SDO1YLR022C 753 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 ARF3YOR094W 552 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YOR169CYOR169C 465 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 RGR1YLR071C 3249 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 SPO71YDR104C 3738 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 PUF6YDR496C 1971 nt2.91□□□□□ -1.94
NMD4Q12129 VPS74YDR372C 1038 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YDR537CYDR537C 606 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YGR107WYGR107W 450 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YIL175WYIL175W 318 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 CSE4YKL049C 690 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 MRPL16YBL038W 699 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YBL065WYBL065W 345 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 BFR1YOR198C 1413 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 PSY2YNL201C 2577 nt2.9□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 JJJ1YNL227C 1773 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SCEIQ0160 708 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RLP24YLR009W 600 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 TAP42YMR028W 1101 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 MPP6YNR024W 561 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SLH1YGR271W 5904 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 BUD4YJR092W 4344 nt2.89□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 TRM2YKR056W 1920 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RRI2YOL117W 1938 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RGC1YPR115W 3252 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YDL187CYDL187C 330 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 TIM11YDR322C-A 291 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RPS26BYER131W 360 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RBL2YOR265W 321 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YBR071WYBR071W 636 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 CEP3YMR168C 1827 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SIP3YNL257C 3690 nt2.88□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 GIS4YML006C 2325 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 NMD2YHR077C 3270 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 ITC1YGL133W 3795 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 snR84snR84 550 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 PPH3YDR075W 927 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 PEA2YER149C 1263 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YGR293CYGR293C 462 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YHL005CYHL005C 393 nt2.87□□□□□ -1.95
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