Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCRN3Q0VDG4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCRN3Q0VDG4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms