Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOBRQ0VD83 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms