Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms