Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNA1Q09470 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA1Q09470 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms