Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms