Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms