Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 COX8YLR395C 237 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YPL205CYPL205C 345 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 DAL5YJR152W 1632 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 FLO1YAR050W 4614 nt2.89□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 TMA64YDR117C 1698 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 SHQ1YIL104C 1524 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 KAR9YPL269W 1935 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 CHO2YGR157W 2610 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 IRC2YDR112W 309 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 SRL3YKR091W 741 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 HOP1YIL072W 1818 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 BCH1YMR237W 2175 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YDR338CYDR338C 2088 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 MSH4YFL003C 2637 nt2.88□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 PDS5YMR076C 3834 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 SEC15YGL233W 2733 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YDR442WYDR442W 393 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 ATX2YOR079C 942 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YHR080CYHR080C 4038 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 MAK21YDR060W 3078 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 ASM4YDL088C 1587 nt2.87□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 GYL1YMR192W 2163 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YCG1YDR325W 3108 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YCR090CYCR090C 549 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RPL9AYGL147C 576 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RPS23AYGR118W 438 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 UNG1YML021C 1080 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RIM9YMR063W 720 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 IMP4YNL075W 873 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RPL23AYBL087C 414 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 ATG3YNR007C 933 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 SFM1YOR021C 642 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YOR169CYOR169C 465 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RPS23BYPR132W 438 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 CWH41YGL027C 2502 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 MAK5YBR142W 2322 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 MDM1YML104C 3384 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 LCB4YOR171C 1875 nt2.86□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RRM3YHR031C 2172 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 CHS3YBR023C 3498 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 CDH1YGL003C 1701 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 OPI6YDL096C 327 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 BTT1YDR252W 450 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 NSA2YER126C 786 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 SYM1YLR251W 594 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YPR096CYPR096C 303 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 DBF20YPR111W 1695 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 BNI4YNL233W 2679 nt2.85□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 STN1YDR082W 1485 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 HFM1YGL251C 3564 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 AHC2YCR082W 387 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YDR090CYDR090C 933 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YGR042WYGR042W 816 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RPL16AYIL133C 600 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 YRR1YOR162C 2433 nt2.84□□□□□ -1.95
SSK1Q07084 RRI2YOL117W 1938 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 EMP70YLR083C 2004 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SRB4YER022W 2064 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YLR278CYLR278C 4026 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SPO14YKR031C 5052 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 COX13YGL191W 390 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YGR242WYGR242W 309 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YKL044WYKL044W 321 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SDO1YLR022C 753 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 AFB1YLR040C 675 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 VID24YBR105C 1089 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 NDT80YHR124W 1884 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 MNT3YIL014W 1893 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 UBP16YPL072W 1500 nt2.83□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YDL009CYDL009C 324 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 DYN2YDR424C 279 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 RPC37YKR025W 849 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 ENV10YLR065C 546 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 BUD21YOR078W 645 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 RPB5YBR154C 648 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 URB2YJR041C 3525 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SSP1YHR184W 1716 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 REG1YDR028C 3045 nt2.82□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 KHA1YJL094C 2622 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YDR193WYDR193W 399 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YGR017WYGR017W 894 nt2.81□□□□□ -1.96
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