Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK18Q07002 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK18Q07002 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms