Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 MST28YAR033W 705 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 ECI1YLR284C 843 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 NBP1YLR457C 960 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 PAI3YMR174C 207 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 INP1YMR204C 1263 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 ATP11YNL315C 957 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 NGL1YOL042W 1092 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 RPL11AYPR102C 525 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 snR43snR43 209 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 NEW1YPL226W 3591 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 PFK26YIL107C 2484 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 SEN54YPL083C 1404 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 MAL33YBR297W 1407 nt1.91□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 SRB4YER022W 2064 nt1.9□□□□□ -2.1
RDS3Q06835 YLR001CYLR001C 2589 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 BOI1YBL085W 2943 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ESL1YIL151C 3357 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 DYN2YDR424C 279 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YEA4YEL004W 1029 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 VMA8YEL051W 771 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YIP5YGL161C 933 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YIL054WYIL054W 318 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YLL044WYLL044W 447 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SUS1YBR111W-A 291 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ADF1YCL058W-A 342 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 BIT61YJL058C 1632 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 PUF6YDR496C 1971 nt1.9□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SLN1YIL147C 3663 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ARK1YNL020C 1917 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ERT1YBR239C 1590 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 PDR1YGL013C 3207 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ESC2YDR363W 1371 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 NTF2YER009W 378 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 MIC19YFR011C 513 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SAE2YGL175C 1038 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 TCD1YHR003C 1290 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 EST3YIL009C-A 546 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YIL012WYIL012W 342 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YKL066WYKL066W 444 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 LIP2YLR239C 987 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YMR181CYMR181C 465 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RPL20AYMR242C 519 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YOL057WYOL057W 2136 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SEC66YBR171W 621 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YAT2YER024W 2772 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RRM3YHR031C 2172 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RGR1YLR071C 3249 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 VPS13YLL040C 9435 nt1.89□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YDR186CYDR186C 2634 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 PTP3YER075C 2787 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SPO71YDR104C 3738 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 MIX14YDR031W 366 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YDR248CYDR248C 582 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 KEI1YDR367W 666 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YEL057CYEL057C 702 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ERG28YER044C 447 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RSR1YGR152C 819 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YHR213WYHR213W 597 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SFT1YKL006C-A 294 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YET1YKL065C 621 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YAR062WYAR062W 597 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 VPS63YLR261C 327 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YNL050CYNL050C 813 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 CUR1YPR158W 759 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YCL002CYCL002C 792 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 CDC55YGL190C 1581 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 APM3YBR288C 1452 nt1.88□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 HAA1YPR008W 2085 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SNA4YDL123W 423 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YAP5YIR018W 738 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 REC102YLR329W 795 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 PDR3YBL005W 2931 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 AFT2YPL202C 1251 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 CBP6YBR120C 489 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ADY4YLR227C 1482 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YCL020WYCL020W 1317 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 PSY2YNL201C 2577 nt1.87□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SHS1YDL225W 1656 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 DBF20YPR111W 1695 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YDR338CYDR338C 2088 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 APC11YDL008W 498 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YPR1YDR368W 939 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 ASG7YJL170C 630 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RPL17BYJL177W 555 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 EMC6YLL014W 327 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RCE1YMR274C 948 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YBL108WYBL108W 306 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 YRO2YBR054W 1035 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 RRG8YPR116W 834 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 snR191snR191 274 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 POM152YMR129W 4014 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SRC1YML034W 2505 nt1.86□□□□□ -2.11
RDS3Q06835 SMC6YLR383W 3345 nt1.86□□□□□ -2.11
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