Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPB1Q06547 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms