Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG1Q06432 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms