Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITIH3Q06033 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITIH3Q06033 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms