Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DEUP1Q05D60 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEUP1Q05D60 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms