Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms