Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PLOD1Q02809 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PLOD1Q02809 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms