Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms