Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP27A1Q02318 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYP27A1Q02318 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms