Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPEQ02224 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms