Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPCQ01831 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPCQ01831 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPCQ01831 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPCQ01831 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPCQ01831 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms