Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms