Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFITM3Q01628 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms