Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEX3Q00994 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms