Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITPNAQ00169 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PITPNAQ00169 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms