Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKD1P98161 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PKD1P98161 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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