Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VLDLRP98155 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms