Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED6P86452 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms