Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD3P84022 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms