Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF3P78545 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF3P78545 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF3P78545 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF3P78545 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF3P78545 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF3P78545 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms