Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA1P78396 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms