Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB4BP68371 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms