Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms