Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P61576 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERV-K104P61576 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms