Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVK-21P61565 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-21P61565 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms