Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3EP60228 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3EP60228 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3EP60228 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3EP60228 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3EP60228 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms