Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP6P59044 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms