Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL3P58215 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms