Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP4P57796 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP4P57796 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP4P57796 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP4P57796 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP4P57796 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CABP4P57796 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CABP4P57796 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CABP4P57796 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CABP4P57796 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms